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Séquences ADN, Otto dans l'outil Analyse, import de réactifs par modèle Excel

2026.10.18-otto-analyse-sequences-adn-modele-reactifs · 2026-10-19

Build livré : 549e7b481f1c6a7d3ae406fc6f4e974bbe7ec844

Changements

  • Nouveau module Séquences : un éditeur de plasmides et de séquences versionnées, avec annotations, conception d'amorces, optimisation des codons, alignements et liens vers les échantillons.
  • Le BLAST se lance depuis une séquence vers un service public de séquençage basé aux États-Unis, après une case à cocher à chaque envoi, puisque la séquence quitte Biotraxion ; chaque envoi est consigné au journal d'audit.
  • Otto lit les bases d'une région et sa traduction, conçoit et ajoute des amorces, optimise les codons d'une CDS sur l'un ou l'autre brin, lance un BLAST et lie une séquence à un échantillon. Chaque écriture passe par une confirmation et crée une nouvelle version.
  • Quand Otto crée une version, l'éditeur ouvert la charge seul ; s'il contient des modifications non enregistrées, il propose de la charger plutôt que de les écraser.
  • Otto pilote l'outil Analyse : classeurs, membres, tables, colonnes, analyses, graphes et leurs réglages (titres, axes, échelles). Chaque geste passe par une carte de confirmation, et les modifications d'une table s'appliquent depuis un bandeau Appliquer ou Ignorer.
  • Les réactifs s'importent depuis un modèle Excel téléchargeable, sans IA : chaque colonne est reprise telle quelle et les erreurs sont signalées ligne par ligne.
  • Le numéro CAS d'un réactif est enregistré à l'import et à l'approbation des propositions ; les dates Excel sont lues correctement et un point-virgule dans une cellule ne coupe plus la ligne.
  • Les messages de l'import de réactifs suivent la langue de l'interface.
  • L'écran de veille animé est retiré et son délai n'apparaît plus dans les réglages ; le verrouillage après inactivité reste inchangé.
  • Après « nouvelle conversation », Otto reprend la page courante comme contexte.

Limites connues

  • Une région qui chevauche l'origine d'un plasmide circulaire ne se lit pas en une fois par Otto.
  • Les chromatogrammes .ab1 n'ont pas encore été éprouvés, et la table de codons CHO repose sur un petit nombre de CDS.
  • Le numéro CAS n'est pas encore affiché sur la fiche d'un réactif, seulement dans la revue d'import.
  • Les étiquettes de graduation peuvent se chevaucher près d'une rupture d'axe sur un graphe.
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